Изначально Неглинка была рекой чистой, но к концу 18 века население Москвы стало сильно расти и в Неглинку с улиц стало стекаться много грязи и помоев, воду из неё признали опасной для здоровья. По плану Екатерины II в 1775 году должны были заключить Неглинку в открытый канал, по берегам устроить бульвары для гулянья, а по восточному берегу реки проложить из Мытищ до Кузнецкого моста водопровод с фонтанами. После пожара 1812 года реку заключают в коллектор, т. к. она, буквально, начинает вонять. Берега бывшего канала стали улицей Неглинной.
К концу 19 века коллектор реки уже не мог справиться с потоком воды, тем более некоторые домовладельцы самовольно "подключались" к коллектору реки и выливали туда всю грязь, поэтому было решено провести ремонт и реконструкцию. В 1906 году в коллектор была убрана часть реки верхнего течения.